Самый старый «почти полный» геном ВИЧ обнаружен в образце ткани 1966 года

Источник материала:

Ученые обнаружили наиболее старый «почти полный» геном ВИЧ в забытом образце ткани 1966 года. Об этом сообщает Live Science со ссылкой на журнал Proceedings of the National Academy of Sciences.

Согласно исследованию, самый старый из известных почти полных геномов штамма ВИЧ был обнаружен в образце ткани из Демократической Республики Конго (ДРК).

Образец был взят в 1966 году, то есть, на 10 лет раньше, чем другой «самый старый» геном ВИЧ, полученный из образца крови, взятого в 1976 году в ДРК.

Подобные генные последовательности, появившиеся еще до того, как ВИЧ был обнаружен научным сообществом в 1983 году, помогают точно определить время возникновения генетических мутаций в вирусе, что, в свою очередь, позволяет ученым отслеживать распространение вируса и сроки, когда он передался людям.

Обнаруженный недавно геном 1966 года, по словам исследователей, согласуется с предыдущими данными о сроках появления ВИЧ. То есть, эволюционные модели ученых оказались верны.

Основываясь на генетическом секвенировании образцов вируса, ученые полагают, что последний общий предок ВИЧ появился в начале 1900-х годов (около 1910-го) в Центральной Африке, распространившись от шимпанзе. Существует несколько штаммов вируса, но те, которые ответственны за 95% случаев во всем мире, находятся в подгруппе, называемой ВИЧ-1, группа М. С начала пандемии более 32 миллионов человек умерли от СПИДа — заболевания, вызванного ВИЧ.

Однако то, что произошло почти за 80 лет, прошедших с начала передачи ВИЧ-1 людям и открытием самого вируса, остается загадкой для ученых. Математические модели скорости мутации вируса намекают на то, что ВИЧ рано или поздно должен был перерасти в пандемию. Однако главный вопрос заключается в том, когда и почему группа М ВИЧ-1 стала настолько «успешной», что вышла на глобальный уровень.

Отчасти проблема заключается в том, что модели, которые хорошо рассчитывают скорость вирусных изменений в последние годы, становятся менее надежными в течение более длительных периодов времени. Генетическая информация со временем теряется: штаммы вымирают из-за естественного отбора или просто благодаря удаче, не оставляя следов своего существования в геномах циркулирующих в настоящее время вирусов.

По этой причине обнаружение старого штамма вируса так важно — это словно недостающая часть головоломки, которая помогает заполнить линию эволюционных изменений.

Проект, возглавляемый биологом из Аризонского университета по имени Майкл Воробей (Michael Worobey), проанализировал 1645 образцов биопсии, собранных в Центральной Африке в период с 1958 по 1966 годы для диагностики заболеваний. Используя ПЦР-диагностику (сейчас такое применяют для обнаружения коронавирусной инфекции), исследователи искали намеки на геномы ВИЧ. Они нашли только одно: последовательность из биопсии лимфатических узлов 38-летнего мужчины.

У ученых есть и более старые фрагменты ВИЧ — один из 1959 года и другой из 1960-го, также из ДРК. Но эти фрагменты не настолько полны, и потому не могут предложить много информации о мутациях вируса. По словам Гризилса, эти фрагменты были также из разных подтипов ВИЧ, то есть, вирус циркулировал в течение некоторого времени среди людей до 1950-х годов.

Следующая цель проекта — выяснить, когда ВИЧ-1 перешел в стадию ускоряющейся эпидемии. Возможно, что некоторые изменения в геноме сделали вирус более заразным, но более вероятно, что большее значение имели социальные изменения. Например, ВИЧ мог начать передаваться во время лечения заболеваний, так как в 1950-е люди еще не могли должным образом стерилизовать иглы. А деколонизация в 1960-х годах могла привести к тому, что люди стали передвигаться или вести себя иначе, чем раньше, что помогло распространению вируса в новых популяциях или более быстрой передаче.